ในประเทศไทย มีคำแนะนำโดยทั่วไปให้ผู้ปลูกหลีกเลี่ยงการใช้มูลสัตว์อินทรีย์ เนื่องจากเชื้อรา Phytophera palmivora ซึ่งเป็นโรคที่สร้างความลำบากให้กับต้นทุเรียนมากที่สุด ได้รับการสนับสนุนจากสภาพดินชื้นที่ระดับพื้นดินรอบๆ ลำต้นที่เกิดจากปุ๋ยคอกและวัสดุคลุมดิน อย่างไรก็ตาม ยังไม่เป็นที่แน่ชัดว่าคำแนะนำดังกล่าวเป็นจริงสำหรับเงื่อนไขอื่นๆ และเมื่อใช้แนวปฏิบัติที่ดีใน การปลูกทุเรียน ปุ๋ยอินทรีย์แบบดั้งเดิมถูกนำมาใช้อย่างได้ผลดีในมาเลเซียและที่อื่นๆ ในหลายพื้นที่ของเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ ต้นทุเรียนกึ่งป่าจะเจริญเติบโตและออกผลได้อย่างสมบูรณ์ด้วยตัวมันเองโดยได้รับการดูแลเอาใจใส่ค่อนข้างน้อย การเพิ่มความสมบูรณ์ของต้นทุเรียนพันธุ์ที่เลือกด้วยวิธีอินทรีย์สมัยใหม่และสารปรับปรุงดิน เช่น ปุ๋ยหมักและฝุ่นหิน มีแนวโน้มที่จะผลิตพืชผลกันชนขนาดใหญ่ที่มีรสชาติอร่อยเกินจินตนาการ