ก่อนที่จะมีการให้วัคซีนชนิดใหม่แก่ผู้คนจะมีการทดสอบในห้องปฏิบัติการอย่างครอบคลุม เมื่อการทดสอบในคนเริ่มขึ้น อาจต้องใช้เวลาหลายปีกว่าที่การศึกษาทางคลินิกจะเสร็จสมบูรณ์และวัคซีนจะได้รับอนุญาตหลังจากได้รับใบอนุญาตวัคซีนแล้ว สำนักงานคณะกรรมการอาหารและยา ฉีดวัคซีน  (FDA), CDC, สถาบันสุขภาพแห่งชาติ (NIH) และหน่วยงานรัฐบาลกลางอื่น ๆ จะดำเนินการติดตามและตรวจสอบข้อกังวลด้านความปลอดภัยที่อาจเกิดขึ้นเป็นประจำคาดว่าจะมีผลข้างเคียงเล็กน้อยวัคซีนก็เหมือนกับยา อาจมีผลข้างเคียงบางอย่าง แต่คนส่วนใหญ่ที่ได้รับวัคซีนมีผลข้างเคียงเพียงเล็กน้อยหรือไม่มีเลย ผลข้างเคียงที่พบบ่อย ได้แก่ มีไข้ อ่อนเพลีย ปวดเมื่อยตามร่างกาย และมีรอยแดง บวม และกดเจ็บบริเวณที่ฉีด ปฏิกิริยาที่ไม่รุนแรงมักจะหายไปเองภายในสองสามวัน  ผลข้างเคียงที่ร้ายแรงและยาวนานนั้นหายากมาก เราทราบดีว่าพบได้ยากเนื่องจาก CDC ติดตามและตรวจสอบรายงานผลข้างเคียงที่ร้ายแรง