สาเหตุของอาการเจ็บคอ ได้แก่ : ไวรัส เช่น ไวรัสที่ทำให้เกิดหวัดหรือไข้หวัดใหญ่ แบคทีเรียกลุ่ม A strep ซึ่งเป็นสาเหตุของคออักเสบ (เรียกอีกอย่างว่า streptococcal pharyngitis) โรคภูมิแพ้ การสูบบุหรี่หรือการได้รับควันบุหรี่มือสอง ในจำนวนนี้ การติดเชื้อจากไวรัสเป็นสาเหตุที่พบบ่อยที่สุดของอาการเจ็บคอ คออักเสบคือการติดเชื้อในลำคอและต่อมทอนซิลที่เกิดจากแบคทีเรีย แบคทีเรียเหล่านี้เรียกว่ากลุ่ม A Streptococcus (เรียกอีกอย่างว่าStreptococcus pyogenes )  อาการเจ็บคอ อาจทำให้กลืนลำบาก อาการเจ็บคออาจทำให้รู้สึกแห้งและเป็นรอยได้ อาการเจ็บคออาจเป็นอาการของโรคคออักเสบ โรคไข้หวัด โรคภูมิแพ้ หรือโรคระบบทางเดินหายใจส่วนบนอื่นๆ อาการเจ็บคอที่เกิดจากเชื้อไวรัสหรือแบคทีเรียกลุ่ม A Streptococcus อาจมีอาการคล้ายกันได้ บางครั้งอาการต่อไปนี้บ่งบอกว่าไวรัสเป็นสาเหตุของโรคแทนที่จะเป็นสเตรปโธรท: ไอ อาการน้ำมูกไหล เสียงแหบ (การเปลี่ยนแปลงของเสียงที่ทำให้หายใจไม่ออก เสียงแหบ หรือเครียด) โรคตาแดง (เรียกอีกอย่างว่าตาสีชมพู )